CRISPR
È rivoluzione in biologia molecolare
Cari ragazzi qui vi parlo di una vera e propria rivoluzione in biologia molecolare. È iniziata nel 2012 e le
conseguenze in molti settori della ricerca scientifica di base e applicata sono già sotto gli occhi di tutti gli
scienziati che ci lavorano.
Il suo nome è CRISPR, che significa Clustered Regularly Interspaced Short
Palindromic Repeats. Il nome non deve spaventarvi, leggete la storia e capirete le potenzialità di
questa tecnologia molecolare.
Nel 2011 ad un convegno scientifico a Puerto Rico si conoscono Emmanuelle Charpentier dell'Università di Umeå
in Svezia e Jennifer Doudna dell'Università di Berkeley in California. Decidono di collaborare per studiare
i meccanismi molecolari con cui i batteri si difendono dai virus che li attaccano. Entrambi i gruppi di ricerca avevano
infatti capito che i batteri sono in grado di "riconoscere" i virus che li infettano mediante una specie di "memoria a DNA".
Nel genoma di molti batteri erano state individuate delle strane sequenze ripetute che contenevano pezzi di
DNA simili al genoma di alcuni batteriofagi, i virus dei batteri. Vicino a queste copie di genoma virale, si trovano
i geni per proteine chiamate Cas, che sono endonucleasi, cioè enzimi che tagliano il DNA. Questi loci
(ricorda locus = posizione di un gene sul cromosoma) funzionano così: le sequenze per le proteine Cas vengono
tradotte in proteine, mentre le sequenze simili al genoma virale sono trascritte in singoli filamenti di RNA.
Questi filamenti di RNA fanno da guida per le endonucleasi Cas. Vale a dire, nel momento in cui entra nella cellula
un genoma virale simile, i batteri lo riconoscono, grazie all'RNA che si appaia alle basi complementari
della sequenza bersaglio, quella del virus, appunto. Il genoma del parassita viene così digerito, cioè distrutto,
dalle endonucleasi. Geniale, no? Si tratta di un vero e proprio
sistema immunitario adattativo; i batteri "conservano" nel loro genoma le tracce di precedenti infezioni virali per poterle
combattere efficacemente quando il virus si ripresenta. Potremmo dire che la "memoria a DNA" dei batteri è paragonabile alle cellule
della memoria del sistema immunitario dei vertebrati.
La rivista Nature ha dedicato uno speciale al metodo CRISPR, dopo l'uscita di un articolo nell'aprile 2015 in cui il metodo è stato utilizzato per modificare uno zigote umano. Qui gli scienziati di tutto il mondo discutono per arrivare ad una regolamentazione dell'utilizzo di questa potente tecnologia. (http://www.nature.com/news/crispr-1.17547) |
La collaborazione tra i gruppi di Emmanuelle e Jennifer porta a capire come funziona Cas9, una di queste endonucleasi
guidate da un filamento di RNA. Ebbene, è rivoluzione! Perché? Con un semplice esperimento provano a sostituire il
filamento di RNA che guida Cas9, lo programmano per "farlo andare" dove vogliono loro e ci riescono. A questo punto è chiaro
che hanno per le mani una nucleasi programmabile! Non solo possono tagliare DNA a piacimento,
ma soprattutto, aggiungendo al
sistema un RNA con una sequenza desiderata, possono anche sostituirla al gene bersaglio.
Dal 17 agosto del 2012 la tecnologia molecolare CRISPR-Cas9 diventa di dominio pubblico. La comunità
scientifica capisce
immediatamente la portata del nuovo mezzo a disposizione. Fino al 2012 per ottenere il modello animale di una malattia genetica per
poterla studiare in vivo ci voleva anche un anno. Spesso, senza il modello animale, cioè un animale che abbia la stessa mutazione che
provoca la malattia nell'uomo, non è possibile avanzare nella
ricerca di una cura. Ora possono bastare poche settimane per ottenere l'animale modificato.
Non tutti gli organismi erano facili
da ingegnerizzare dal punto di vista genetico. In meno di due anni, si è provata la tecnologia CRISPR dalle cellule in
coltura, ai batteri, alle piante, ai vermi, alle rane, al lievito e sembra funzionare sempre con la stessa semplicità.
Inoltre e non certo meno importante, si tratta di una tecnologia poco costosa, alla portata di tutti i laboratori di biologia molecolare.
I risultati non si sono fatti attendere. Il numero di pubblicazioni scientifiche, che utilizzano il metodo CRISPR, è
aumentato esponenzialmente. Nel 1983 Kary Mullis, Nobel per la chimica nel 1993, ideò la PCR, la
reazione a catena della polimerasi, che permette di amplificare una sequenza di DNA anche a partire da un capello (avete mai visto
CSI?!!!). Ebbene, fu una rivoluzione. Ora stiamo vivendo un altro momento storico per la biologia molecolare. La scienza va veloce
in questi casi. C'è già chi parla di gene drive!!! Alcuni ricercatori hanno infatti dimostrato che si può usare la
tecnica CRISPR per far diffondere in modo esplosivo una mutazione introdotta in una popolazione di drosofile, i moscerini della frutta. Certo se
i coltivatori di ulivi italiani avessero avuto un sistema di questo tipo per sconfiggere la mosca che ha mandato in malora il raccolto del 2014, forse
sarebbero stati contenti di metterlo in atto. E le "povere" mosche?
Jennifer Doudna spiega l'esplosione dell'utilizzo del metodo CRISPR. Il numero delle pubblicazioni scientifiche, in cui viene usato, è aumentato esponenzialmente dalla sua scoperta (2012). (Immagine ripresa dal video: https://www.youtube.com/watch?v=SuAxDVBt7kQ) |
Non c'è dubbio, il metodo CRISPR sta rivoluzionando il modo di fare ricerca di base ed applicata, ma proprio per la sue enormi potenzialità
la comunità scientifica ha iniziato una discussione per arrivare ad una regolamentazione del suo utilizzo. In particolare,
l'argomento che si vuole affrontare
è quello della modifica genetica delle linee germinali umane (human genome editing).
Penso che tutti vorrebbero vedere corretto il gene che provoca una malattia in un bambino, tutti sarebbero d'accordo nell'utilizzare
questa tecnologia per arrivare ad una cura per il cancro o per terribili malattie come quelle neurodegenerative. Ma di fronte ad una tecnologia così
potente e facile da usare, gli scienziati devono semplicemente stabilire delle regole e confrontarsi sui pro e i contro.
Nel 1975 ad Asilomar in California, gli scienziati del "DNA ricombinante" si riunirono e sottoscrissero le linee guida per l'utilizzo della
neonata ingegneria genetica, mettendo in primo piano la biosicurezza. Oggi, gli scienziati stanno organizzando una nuova conferenza
al fine di stabilire una regolamentazione per utilizzare al meglio il metodo CRISPR.
Alla fine di questa storia voglio che facciate una riflessione. Gli scienziati hanno avuto l'idea del metodo CRISPR studiando come i batteri si difendono
dai virus. È questa l'ennesima dimostrazione di come la ricerca di base sia di fondamentale importanza per il
progresso scientifico e tecnologico. Senza l'ingegneria genetica non avremmo l'ormone della crescita, o l'insulina, o
i vaccini ricombinanti. E pensare che tutto questo è stato possibile perché qualcuno con passione ha studiato come funzionano i batteri e
ha prestato attenzione ad un batterio, in particolare, di nome
Thermus aquaticus che vive nelle pozze di acqua calda del parco nazionale di Yellowstone, negli Stati Uniti... E questa è
un'altra gran bella storia.
Manuela Casasoli (manuela_casasoli@yahoo.it)